Ο αριθμός των φοιτητών στο Πανεπιστήμιο Αιγαίου αυξάνει σταδιακά με την ωρίμανση των Τμημάτων του και, σήμερα, η φοιτητική κοινότητα του Πανεπιστημίου κοντεύει τους 8000 φοιτητές.

Οι φοιτητές στις νησιωτικές Πανεπιστημιακές Μονάδες αξιοποιούν τα πλεονεκτήματα της μικρής κοινωνίας των νησιών, ενώ απολαμβάνουν τις δυνατότητες κινητικότητας που προσφέρονται από το Πανεπιστήμιο με τα Ευρωπαϊκά Προγράμματα Ανταλλαγών (ERASMUS/SOCRATES), τα Προγράμματα της AIESEC καθώς και τα προγράμματα Youth for Europe, τα οποία προωθούν οι φοιτητικοί σύλλογοι.